Singapur’dan San Francisco’ya gece yarısı havalanan uçakta, eski FBI ajanı Lucas Reyes son görevini tamamlamak zorundadır. Hedefi, Hayalet kod adlı, uluslararası suç dünyasında iz bırakan bir suçluyu yakalamaktır. Ancak operasyon ilerledikçe, karşısındaki kişinin acımasız bir terörist değil, yıllar önce insan kaçakçılarının elinden kurtulmuş ve şimdi zenginlerden çalıp fakirlere yardım eden Isha olduğunu öğrenir. Isha’nın başına konan dev ödül, uçaktaki yolcuların arasına ölümcül suikastçılar ve ödül avcılarını katmıştır. Artık uçak, basit bir yolcu uçağı değil, ölümcül bir savaş alanına dönüşmüştür.
Lucas, Isha’yı adalete teslim etmek ile hayatta kalmak arasında sıkışıp kalmıştır. Uçakta kimin dost, kimin düşman olduğu belirsizdir. Uçuş boyunca sinsice ilerleyen bir av ve avcı oyunu başlamıştır. Paralı askerler ve tetikçiler her an saldırmaya hazırdır. Ancak Lucas için tehlike yalnızca onlardan ibaret değildir. Geçmişi de peşini bırakmamaktadır. Bir zamanlar düşmanlarını ortadan kaldıran usta bir ajan olan Lucas, şimdi kendisi hedef haline gelmiştir.
Kaçacak bir yer yoktur. Zaman daralmaktadır. Kabindeki çatışmalar kontrolden çıkarken, uçaktaki yolcular büyük bir paniğe sürüklenmiştir. Uçak, içinde barındırdığı şiddet nedeniyle bir felaketin eşiğine gelmiştir. Lucas ve Isha’nın hayatta kalabilmesi için tek seçenekleri vardır. Ya birlikte savaşacaklar ya da bu uçuş, ikisi için de son yolculuk olacaktır.