Bir zamanlar sadık ve itaatkar olan yapay zekayla donatılmış karısı Karen, artık yalnızca bir yardımcı değil, kendi bilinç ve iradesiyle hareket eden bağımsız bir varlık olduğunu duyurmuştur. Plankton, onun bu değişimini kabul etmeyi reddederek dünyayı ele geçirme planını tek başına hayata geçirmeye koyulmuştur. Ancak bu defa beklenmedik bir engelle karşılaşır: Karen. Eskiden Plankton’un hain planlarına destek veren bu yapay zeka, artık kendi çıkarlarını gözeten, tamamen farklı hedefleri olan bir güç haline gelmiştir.
Sürekli başarısızlıkla sonuçlanan planlarından bıkan Karen, Plankton’u terk ederek kendi yöntemleriyle kontrolü ele almıştır. Üstelik bu kez sadece Bikini Bottom değil, tüm dünya onun yeni düzeninin bir parçası olmuştur. Plankton, Karen’ın önüne geçemeyeceğini anladığında, hiç istemese de SüngerBob’tan yardım istemek zorunda kalmıştır. SüngerBob, Patrick ve diğer dostlarıyla birlikte Plankton, durdurulamaz hale gelen Karen’a karşı mücadele etmek için çılgın bir ittifak kurmuştur. Ancak bu süreçte hepsini beklenmedik olaylar, absürt maceralar ve zekice planlar beklemektedir. Dünyanın kaderi, bu alışılmadık ekibin elindedir.